品牌货号 别名 | 阿拉丁T750874 T4 RNA 连接酶 2,截短型 | 截短型T4RNA连接酶2 | RNA连接酶2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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英文别名 | T4 Rnl2, truncated | Rnl2 (1-249) | RNA ligase 2 | rnlB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
规格或纯度 | 生物活性, ActiBioPure™, EnzymoPure™, 无动物源, 无载体, 无菌, 无DNA酶和RNA酶, 无蛋白酶, ≥95%(SDS-PAGE), 200 U/µL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
稳定性与储存 | 长期储存-20℃(24个月);避免反复冻融。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
英文名称 | T4 RNA Ligase 2, truncated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
单位定义 | 200 units is defined as the amount of enzyme required to give 80% ligation of a 31-mer RNA to the pre-adenylated end of a 17-mer DNA in a total reaction volume of 10 μl in 1 hour at 25℃. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
储存温度 | -20°C储存,避免反复冻融 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
运输条件 | 超低温冰袋运输 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
产品介绍 | 本公司生产的T4RNA连接酶2截短型(T4Rnl2,truncated或Rnl2(1-249)),该酶仅包含T4RNA连接酶2N端249个氨基酸,可特异性地将5'端预腺苷酰化的DNA或RNA(App-DNA或App-RNA)连接到RNA的3'羟基。T4RNALigase2,truncated与T4RNALigase2的酶活性完全不同,后者是一种ATP依赖的dsRNAligase,而前者是一种不依赖于ATP的,依赖于5'端预腺苷酰化的单链核酸连接酶。T4RNALigase2,truncated常用于microRNA(miRNA)等3'端为羟基的单链RNA在克隆、高通量测序建库或PCR检测等时,在3'羟基端添加5'端预腺苷酰化的DNA或RNA接头。T4RNALigase2,truncated只能利用5'端预腺苷酰化的单链DNA或RNA作为3'端接头,因此可以大大降低连接反应的背景,通常是小RNA等建库时的优先选择。T4RNALigase2,truncated连接时不需要ATP,但需要5'端预腺苷酰化(也称预腺苷化、腺苷酰化或腺苷化)底物。即使在有ATP存在的情况下,T4RNALigase2,truncated也不能催化连接单链DNA或RNA5'-P末端与3'-OH末端之间形成磷酸二酯键。而T4RNALigase1可以在ATP存在的情况下,催化连接单链DNA或RNA5'-P末端与3'-OH末端之间形成磷酸二酯键。因此T4RNALigase2,truncated特别适用于smallRNAlibrary的制备,不管是进行miRNA的测序还是进行directionalmRNA-Seq,该酶都可以提高建库的质量,并有效降低连接反应的背景。 纯度(Purity):无 DNA 内切酶和外切酶活性,无 RNA 酶活性,无蛋白酶活性。
产品应用 5'末端预腺苷酰化的单链 DNA 或者 RNA 与单链 RNA 的 3'羟基末端连接;cDNA 文库构建中连接 5'末端预腺苷酰化单链寡核苷酸和小 RNA;链特 异性的 cDNA 文库(strand-specific cDNA library)构建中连接 5'末端预腺苷酰化单链寡核苷酸和 RNA;二代测序中,miRNA 文库构建中 RNA 的 3'末端与接头之间的连接;cDNA 文库的构建以进行小 RNA 转录组分析(small-RNA transcriptome analysis)。 产品优势 T4 RNA Ligase 2, truncated 常用于 microRNA (miRNA)等 3'端为羟基的单链 RNA 在克隆、高通量测序建库或 PCR 检测等时,在 3'羟基端添加 5' 端预腺苷酰化的 DNA 或 RNA 接头。 使用说明 1.用于连接 5'端腺苷酰化并且 3'端不是羟基的(例如为氨基)单链 DNA (AppDNA-NH2)和 3'端为羟基的单链 RNA (ssRNA)的使用说明具 体如下。需要提前准备好待连接的样品,以及 Universal miRNA Cloning Linker 或自备的适当接头。 2.参考下表在冰浴中配制如下反应体系:
注意: a.由于涉及 RNA 操作,需要严格按照 RNA 操作的规范进行,避免 RNase 污染,相关试剂和耗材需要经过 DEPC 处理去除 RNase 或者 确保是 RNase free 的。推荐在连接体系中添加 RNase Inhibitor,以避免 ssRNA 或其连接产物的降解,尽管经测试我们发现在严格操作 的情况下,不加 RNase Inhibitor 也不会导致 ssRNA 或其连接产物发生明显降解。 b.进行连接反应时,如果样品 RNA 比较珍贵,希望充分被连接,可以按照接头和样品 RNA 的摩尔比为 2:1 的比例进行连接;如果样品 RNA 比较充裕,同时感觉接头的成本偏高时,可以按照接头和样品 RNA 的摩尔比摩尔比 1:1 甚至 1:2 的比例进行连接反应,这样可以很 好地节省接头。ssRNA 的用量可以根据实际的样品量进行适当调节,相应的接头的用量也按照比例进行适当调整即可。 c.如果同时进行多个连接反应,可以把上表中除 ssRNA 之外的所有溶液和酶提前预混合,然后再分装到各反应管内。 3.连接反应:25℃, 孵育 60min。为了使连接反应更加充分,可以适当延长连接反应时间。 4. 终止反应:65℃,孵育 20min。 保存条件: -20℃保存,≤0℃运输 注意事项: (1)本产品提供的试剂均用不含 DNA 酶和 RNA 酶的水配制,可直接用于 3'端为羟基的单链 RNA 和 5'端腺苷酰化的 DNA 或 RNA 之间的连接反 应。 (2)可根据具体应用选择合适的操作方法,可能需准备额外的试剂,如 RNase inhibitor、DEPC 水等。 (3)使用本产品连接 ssRNA 和 AppDNA 时,建议使用的 PEG8000 的浓度为 10%-30%,适当提高 PEG8000 的浓度,会显著提高 T4 Rnl2, truncated 的催化的连接效率,而不改变其反应特性。 (4)本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。 (5)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。 |
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