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来自菠萝茎的菠萝蛋白酶已被用于: 评估由离子液助表面活性剂组成的双水相胶束系统作为十二烷基硫酸钠(SDS)/聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和细胞增殖试验中的阳性对照 研究其潜在的镇痛作用并评估其对含有脑啡肽序列的前脑啡肽(PENK)衍生肽的水解作用菠萝蛋白酶可用于抑制促炎前列腺素的生物合成。可用于降低凝血效率。来自菠萝茎的菠萝蛋白酶已被用于制备蜜蜂采集的花粉的酶水解产物。