品牌货号 英文名称 | 阿拉丁M669928 Magbead Soil And Stool DNA Kit | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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储存温度 | 室温 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
运输条件 | 常规运输 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
产品介绍 |
产品简介 该试剂盒提供了一种简单、快速、高效的提取DNA方法,适用于土壤和粪便样本。 在高盐存在时, DNA结合于硅基包被的Magbeads表面。漂洗后,高纯度的DNA被洗 脱于Buffer EBL或去离子水中。纯化得到的DNA纯度好(A260/280的比值在1.7-1.9之间), 完整度高(>15 kb),可用于二代测序、定量PCR、芯片检测等下游实验。 该试剂盒可与CWE2100或CWE3200 32通道核酸提取仪和CWE9600或CWE960 96通道核酸提取仪进行匹配使用,简单、快速地进行高通量提取,大大降低了实验者 的工作量和实验中的人为误差。 自备仪器、试剂 1. 恒温混匀仪 2. 2/15 mL磁力架 3. 32通道核酸提取仪 4. 96通道核酸提取仪 5. 96 DW Plate 6. 8 channel Comb 7. Spin tips pack 8. 无水乙醇,异丙醇 9. 涡旋振荡仪或组织研磨仪 注意事项 1. **次使用前按照试剂瓶标签向Buffer GW1和Buffer GW2中加入无水乙醇并做好标 记。 2. Magbeads严禁冰冻、离心。冰冻、离心可能会对Magbeads造成不可逆的损害。 操作步骤 1. 样本前处理 1.1 短暂离心Lysis Tube以使珠子沉淀在底部。 1.2 A. 向 Lysis Tube中加入0.1-0.3g土壤或粪便样本,加入740-820 μL Buffer QSL与4 μLRNase A,旋紧管盖,短暂涡旋以混合。 B.若为非裂解型粪便保存液保存的粪便样本,向Ly- sis Tube中加入200 μL- 600 μL固液混合物,13000 rpm离心1 min,弃掉保存液 (若离心后的固体量过少,可再次富集,但不宜超过 0.3 g )。加入620 μL Buffer QSL和4 μL RNase A,旋紧管盖,短暂涡旋以混合。 1.3 将Lysis Tube固定在装有2mL适配器的振荡研磨装置中,并根据您的设备使用优 化的研磨条件进行处理(参见附录)。 1.4 将Lysis Tube在恒温混匀仪上以70℃,1200rpm振荡10 min。随后13000 rpm离 心2 min以沉淀固体颗粒。转移540 μL上清液至新的2 mL离心管。 1.5 加入180 μL Buffer RIL,涡旋5 sec ,13000 rpm离心2 min。 注意: Buffer RIL待即将使用前取出,用完立即放在 2-8℃储存。 1.6 手动提取按第2部分操作,全自动核酸提取仪按第3或4部分操作。 2. 手动提取 2.1 在离心管中依次加入160 μL Buffer ML、480 μL 步骤 1.5 的上清液、320 μL 异丙醇、 20 μL Magbeads SN,涡旋振荡混匀5 sec后将离心管放于25℃、 1600 rpm的恒温 混匀仪上振荡混匀10 min。 注意: Magbeads SN加入前需涡旋振荡 20秒使其充分混匀。 Magbeads SN可与异丙醇按照上述 体积根据样本数量预混然后加入。 2.2 将离心管放于磁力架上静置1 min,待Magbeads完全吸附于离心管侧壁后彻底弃 去溶液(保持离心管固定于磁力架上)。 2.3 将离心管从磁力架上取下,加入750 μL Buffer GW1(使用前请检查是否已加入无 水乙醇)后涡旋点震1 min或涡旋振荡5 sec后放于25℃、 1600 rpm的恒温混匀仪 上振荡混匀2 min(振荡过程中确保Magbeads处于混匀状态)。之后将离心管放 于磁力架上静置1 min,待Magbeads完全吸附于离心管侧壁后轻轻颠倒磁力架将 离心管盖上的杂质洗落后彻底弃去溶液(保持离心管固定于磁力架上)。 2.4 重复步骤2.3。 2.5 将离心管从磁力架上取下,加入750 μL Buffer GW2(使用前请检查是否已加入无 水乙醇)后涡旋点震1 min或涡旋振荡5秒钟后放于25℃、 1600 rpm的恒温混匀仪 上振荡混匀2 min(振荡过程中确保Magbeads处于混匀状态)。之后将离心管放 于磁力架上静置1 min,待Magbeads完全吸附于离心管侧壁后轻轻颠倒磁力架将 离心管盖上的杂质洗落后彻底弃去溶液(保持离心管固定于磁力架上)。 2.6 重复步骤2.5。 2.7 保持离心管固定于磁力架上,用移液器进一步去除离心管管底和管盖上的溶液, 之后室温放置5-10分钟,使乙醇挥发干净(肉眼观察磁珠表面变成哑光且磁珠无 干裂)。 2.8 将离心管从磁力架上取下,加入50 -200 μL Buffer EBL。涡旋振荡使磁珠完全悬 浮于洗脱液中后将其放于56℃、 1600 rpm的恒温混匀仪上振荡洗脱10 min,或将 离心管放于56℃水浴锅中孵育10 min,期间每隔3 min涡旋振荡10 sec。 2.9 将离心管放于磁力架上静置2 min,待Magbeads完全吸附于离心管侧壁后用移液 器将洗脱液转移至新的离心管中-20℃保存备用。 3. 与32通道核酸提取仪匹配 3.1 按下表向96DW深孔板中加入相应试剂。
注意: 1. 1&7 Colume中试剂按照顺序依次加入。 2. GW1、GW2使用前请检查是否已加入无水乙醇。 3. Buffer GW2与Magbeads SN 可按照上述体积根据样本数量预混,使用前涡旋 10 sec混匀。 3.2 将加入试剂的深孔板和磁套放于32通道核酸提取仪的相应位置,运行提取程序。约40 min后程序运行结束。 3.3 将深孔板6&12列中的洗脱产物转移至1.5 mL离心管中-20℃保存。 4. 与96通道核酸提取仪匹配 4.1 按下表向96DW深孔板中加入相应试剂。
注意: 1. Plate1中试剂按照顺序依次加入。 2. GW1 、GW2使用前请检查是否已加入无水乙醇。 3. Buffer GW2与Magbeads SN可按照上述体积根据样本数量预混,使用前涡旋 10 sec混匀。 4.2 将加入试剂的深孔板和磁套放于CWE960(磁套置于盘位4)或CWE9600(磁套 置于盘位8)的相应位置,运行提取程序,约50 min后程序运行结束。 4.3 将深孔板Plate 6中的洗脱产物转移至1.5 mL离心管中-20℃保存。 附录: 使用以下方法之一研磨样本: 1. 在涡旋振荡仪上以最大速度手动涡旋振荡10 min。 2. 在搭配有1.5-2 mL水平离心管支架的涡旋振荡仪上以最大速度振荡10 min(让Lysis Tube保持水平放置)。若样本数量超过12,延长5-10 min。 例如使用Scientific Industries或Mobio的Vortex-Genie2 涡旋振荡仪。 3. 使用Qiagen的TissueLyser II时,以25Hz研磨10 min。 4. 使用Qiagen的PowerLyzer 24 Homogenizer时,以2000 rpm 的速度均质化30 sec ,暂停30 sec,然后以2000 rpm的速度再次均质化30 sec。 5. 使用MP Biomedicals的FastPrep-24时,推荐速度为 6.0,时间为 40 sec。 |
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