品牌货号 英文名称 | 阿拉丁R669871 RNApure FFPE Kit | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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储存温度 | 室温,-20°C储存,避免反复冻融 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
运输条件 | 超低温冰袋运输 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
产品介绍 | 产品内容
产品简介 本试剂盒适用于从福尔马林固定、石蜡包埋的组织中有效纯化总RNA。适合从小于30 mg的石蜡包埋组织或切片中抽提高纯度的总RNA,本试剂盒无需使用酚/氯仿抽提和异丙醇沉淀,一小时内即可完成多个样品的抽提。本品使用专门优化的裂解液和蛋白酶K,释放福尔马林固定或组织切片样本中的RNA,无需过夜操作;消化后的样品在较高的温度孵育后,去除由福尔马林交联造成的抑制作用,有效释放组织切片中的RNA,而避免危害RNA的完整性;优化的缓冲系统使裂解液中的RNA可特异结合到硅胶吸附膜上,而其他污染物可流过膜;可通过漂洗步骤有效去除,经过洗脱的RNA可直接用于RT-PCR、Real-Time PCR和印迹分析等实验。 自备试剂:无水乙醇(新开封或提取RNA专用)、10mM PBS(PH7.4)。 实验前准备及重要注意事项 1. 向Proteinase K中加入0.625 ml Proteinase K Storage Buffer使其溶解,-20℃保存。配制好的Proteinase K勿长时间室温放置,避免反复冻融,以免影响其活性。 2. 预防RNase污染,应注意以下几方面: 1) 使用无RNase的塑料制品和枪头,避免交叉污染。 2) 玻璃器皿应在使用前于180℃高温下干烤4小时,塑料器皿可在0.5 M NaOH中浸泡10分钟,用水彻底冲洗后高压灭菌。 3) 配制溶液应使用无RNase的水。 4) 操作人员戴一次性口罩和手套,实验过程中要勤换手套。 3. 获得样品后,要尽快将样品在4%-10%的福尔马林中固定,固定时间以14-24小时为宜,时间过长易导致RNA断裂,影响下游实验。 4. 确保包埋前的样品彻底脱水,残留的福尔马林会抑制Proteinase K的作用。 5. **次使用前应按试剂瓶标签说明先在Buffer RW2中加入无水乙醇。 使用前请检查Buffer GTL、Buffer GL和Buffer DS是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀, 请将Buffer GTL、Buffer GL和Buffer DS于56℃水浴重新溶解。 操作步骤 1. 样本处理 1a. 石蜡包埋样本:用手术刀将组织块中多余的石蜡修剪掉,露出组织后切成5-10 µm的薄片。 注意:如果样品表面已经暴露在空气中,请将接触空气的2-3片弃掉不用。 1b. 福尔马林等固定液中的样本:取约20 mg的样本,切成小块,置于离心管中,加入500 μl 10mM PBS(PH7.4),涡旋振荡,12,000 rpm(~13,400×g)离心1分钟,弃上清,重复3次,可直接进行第3步操作。 2. 选择方案 A 或方案 B 去除石蜡方案 A A1. 取约1×1 cm2的切片(共约4-5片切片)置于离心管(自备)中,加入500 μl Buffer DS,涡旋震荡10秒。56°C孵育3分钟。 A2. 12,000 rpm离心2分钟,小心吸弃上清,注意不要吸到沉淀。 方案 B B1. 取约1×1 cm2的切片(共约4-5片切片)置于离心管(自备)中,加入1 ml二甲苯, 盖紧管盖,涡旋震荡10秒。 B2. 12,000 rpm离心2分钟,小心吸弃上清,注意不要吸弃沉淀。 B3. 加入1 ml无水乙醇,涡旋震荡混匀。12,000 rpm离心2分钟,弃上清,注意不要吸弃沉淀。 B4. 打开管盖,室温或最高至37°C孵育10分钟,直至无乙醇残留。 3. 加入150 μl Buffer GTL,重悬沉淀;加入10 μl Proteinase K,涡旋震荡混匀。 4. 56℃孵育15分钟,直至样品完全溶解。80℃孵育15分钟。短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。 注意:1)此步骤的目的是修复由甲醛变性的核酸,孵育的温度过高或时间过长可能造成RNA断裂 , 产 生 RNA 碎片 。 2)56℃孵育后的样品可置于室温,直至水浴锅或干浴锅温度达到80℃后再把样品置于80℃孵育。 5. 置于冰上3min,12,000 rpm离心15分钟,将上清转移至新的离心管中,小心不要吸到沉淀。 6. 在上清中加入320 μl Buffer GL,涡旋震荡彻底混匀。 7. 加入720 μl无水乙醇,涡旋震荡彻底混匀。 注意:加入无水乙醇后,可能有少量沉淀物析出,但不影响后续操作。 8. 将步骤7中所得的溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns RS) 中, 若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液, 将吸附柱重新放回收集管中。 可选步骤:若需去除基因组DNA,可按照以下步骤进行 a. 向吸附柱中加入350 μl Buffer RW1,12,000 rpm离心1分钟,弃废液,将吸附柱重新放回收集管中。 b. 配制DNase I 混合液:取52 μl RNase-Free Water,向其中加入8 μl 10×Reaction Buffer和20 μl DNase I(1 U/μl),混匀, 配制成终体积为80 μl的反应液。 c. 向吸附柱中直接加入80µl DNase I 混合液,20-30℃孵育15分钟。 d.向吸附柱中加入350 μl Buffer RW1,12,000 rpm离心1分钟,弃废液,将吸附柱重新放回收集管中。 9. 向吸附柱中加入500 μl Buffer RW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 10. 重复步骤9。 11. 12,000 rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟以彻底晾干。 注意:这一步目的是将吸附柱中残余乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应(酶切、PCR等)。 12. 将吸附柱置于一个新的无RNase离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入20-50 μl RNase-Free Water,室温放置2-5分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集RNA溶液,-20℃保存RNA。 注意:1)RNase-Free Water体积不应小于20μl,体积过小影响回收率。2)如果要提高RNA的产量,可用20-50 μl新的RNase-Free Water重复步骤12。 3)如果要提高RNA浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,重复步骤12。 |
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