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  • 细菌基因组DNA提取试剂盒
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  • 细菌基因组DNA提取试剂盒

    实验室耗材
    阿拉丁
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商品参数
  • 所属类别:实验室耗材
  • 产品品牌:阿拉丁
  • 价格区间:0-2000
商品描述


品牌货号


英文名称

阿拉丁B669951


Bacteria Genomic DNA Kit

储存温度室温
运输条件常规运输
产品介绍
B669951Component50TStorage
B669951ABuffer ATL15 mLRT
B669951BBuffer AL15 mLRT
B669951CBuffer AW1 (concentrate)13 mLRT
B669951DBuffer AW2 (concentrate)15 mLRT
B669951EBuffer EB15 mLRT
B669951FProteinase K1.25 mLRT
B669951GSpin Columns DM with Collection Tubes50 setsRT

产品简介

本试剂盒适用于从革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌中提取高纯度总DNA,每次可处理106-108个细胞,获得多至20 μg的总DNA。纯化过程中不需苯酚或氯仿等有毒溶剂, 无需乙醇沉淀,一小时内即可获得高纯度DNA。本试剂盒采用优化的缓冲体系使裂解液中的DNA高效特异的结合到硅基质离心吸附柱上,而其他污染物可流过膜,PCR和其他酶促反应的抑制剂可通过两步洗涤步骤被有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗  脱,即可获得高纯度DNA。纯化得到的DNA可以直接用于酶切、PCR、Real-Time PCR、文库构建、Southern Blot、分子标记等下游实验。

自备试剂:无水乙醇;提取革兰氏阳性菌需自备Enzymatic Lysis Buffer。

Enzymatic Lysis Buffer配制方法:20 mM Tris,pH8.0;2 mM Na2-EDTA,pH8.0;1.2% Triton X-100。121℃灭菌处理20分钟,加入适量的Lysozyme(溶菌酶)其终浓度为20 mg/ml。

实验前准备及重要注意事项

1. 向Proteinase K中加入1.25 ml Proteinase K Storage Buffer使其溶解,-20℃保存。配制好的Proteinase K勿长时间室温放置,避免反复冻融,以免影响其活性。

2. 样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。

3. 如果提取次生代谢产物大量积累或细胞壁厚的细菌培养物的基因组,建议在对数生  长期早期收集样品。

4. **次使用前应按照试剂瓶标签的说明在Buffer GW1和Buffer GW2中加入无水乙醇。

5. 使用前请检查Buffer GTL和Buffer GL是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀出现,请将Buffer GL和Buffer GTL于56℃水浴重新溶解。

6. 如果下游实验对RNA污染比较敏感,可以在加入Buffer GL前加入4 μl DNase-Free的RNase A(100 mg/ml),RNase A本试剂盒并未提供。

如果提取样品为革兰氏阳性菌,需客户自行配制Enzymatic Lysis Buffer处理菌体,其中需使用浓度为20 mg/ml的Lysozyme(溶菌酶),Lysozyme本试剂盒并未提供。

操作步骤

ⅰ革兰氏阴性菌基因组DNA的提取

1. 取细菌培养物1-5 ml(106-108个细胞,最多不超过2×109个细胞)置于离心管(自备) 中,12,000 rpm(~13,400×g)离心1分钟,尽量吸净上清。

2. 向沉淀中加入180 μl Buffer GTL,振荡使菌体重悬。

3. 加入20 μl Proteinase  K,涡旋混匀,56℃孵育,直至溶液变清亮,孵育过程中每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样本分散。

注意:如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4 μl浓度为100 mg/ml 的RNase A溶液,震荡混匀,室温放置5-10分钟。

4. 加入200 μl Buffer GL,涡旋震荡充分混匀。加200 μl无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。

短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。

注意:1)如果多个样品一起操作,Buffer GL和无水乙醇可以等比例混匀后一起加入,震荡混匀。2)加入Buffer GL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。

5. 将步骤4所得溶液(包括形成的沉淀)全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心1分钟,弃废液,将吸附柱放回收集管中。

6. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

7. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤7。

8.12 ,000 rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应(酶切、PCR等)。

9.将吸附柱置于一个新的离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200 μl Buffer GE,室温放置2-5分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。注意:1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0时洗脱效率不高。

2) 离心之前室温孵育5分钟可以增加产量。

3) 用另外的50-200 μl Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。

4) 如果要提高DNA的终浓度,可以将步骤9所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤9;若洗脱体积小于200 μl,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1 μg,推荐用50 μl Buffer GE或灭菌水洗脱。

5) 保存在水中的DNA会受到酸性水解作用影响,如需长期保存,推荐用Buffer GE洗脱并于-20℃保存。

ⅰⅰ革兰氏阳性菌基因组DNA的提取

1. 取细菌培养物1-5 ml(106-108个细胞,最多不超过2×109个细胞)置于离心管(自备) 中,12,000 rpm(~13,400×g)离心1分钟,尽量吸净上清。

2. 加入180 μl Enzymatic Lysis Buffer(自备)使菌体重悬。

Enzymatic Lysis Buffer配制方法见说明书前部分自备试剂。

3.37℃孵育30分钟。

4.加入20 μl Proteinase K涡旋震荡,充分混匀。加入200 μl Buffer GL,涡旋震荡混匀。

注意:不要把Proteinase K直接加到Buffer GL中。

5.56℃孵育30分钟。

注意:1)如果需要,95°C孵育15分钟可以使病原体失活,但是95°C孵育会造成一些DNA的降解。

2)如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4 μl浓度为100 mg/ml的RNase A溶液,震荡混匀,室温放置5-10分钟。

6. 加入200 μl无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。

注意:加入无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。

7. 将步骤6所得溶液(包括形成的沉淀)全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM),若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

8. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

9. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤9。

10.12,000   rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟彻底晾干。

注意:这一步目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应(酶切、PCR等)。

11.将吸附柱置于一个新离心管(自备)中,向吸附柱中间部位悬空加入50-200 μl Buffer GE,室温放置2-5分钟,12,000    rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。

注意:1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0时洗脱效率不高。

2) 离心之前室温孵育5分钟可以增加产量。

3) 用另外的50-200 μl Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。

4) 如果要提高DNA的终浓度,可以将步骤11所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤11; 若洗脱体积小于200 μl,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1 μg, 推荐用50 μl Buffer GE或灭菌水洗脱。

5) 保存在水中的DNA会受到酸性水解作用影响,如需长期保存,推荐用Buffer GE洗脱并于-20℃保存。


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