品牌货号 英文名称 | 阿拉丁B669951 Bacteria Genomic DNA Kit | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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储存温度 | 室温 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
运输条件 | 常规运输 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
产品介绍 |
产品简介 本试剂盒适用于从革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌中提取高纯度总DNA,每次可处理106-108个细胞,获得多至20 μg的总DNA。纯化过程中不需苯酚或氯仿等有毒溶剂, 无需乙醇沉淀,一小时内即可获得高纯度DNA。本试剂盒采用优化的缓冲体系使裂解液中的DNA高效特异的结合到硅基质离心吸附柱上,而其他污染物可流过膜,PCR和其他酶促反应的抑制剂可通过两步洗涤步骤被有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗 脱,即可获得高纯度DNA。纯化得到的DNA可以直接用于酶切、PCR、Real-Time PCR、文库构建、Southern Blot、分子标记等下游实验。 自备试剂:无水乙醇;提取革兰氏阳性菌需自备Enzymatic Lysis Buffer。 Enzymatic Lysis Buffer配制方法:20 mM Tris,pH8.0;2 mM Na2-EDTA,pH8.0;1.2% Triton X-100。121℃灭菌处理20分钟,加入适量的Lysozyme(溶菌酶)其终浓度为20 mg/ml。 实验前准备及重要注意事项 1. 向Proteinase K中加入1.25 ml Proteinase K Storage Buffer使其溶解,-20℃保存。配制好的Proteinase K勿长时间室温放置,避免反复冻融,以免影响其活性。 2. 样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。 3. 如果提取次生代谢产物大量积累或细胞壁厚的细菌培养物的基因组,建议在对数生 长期早期收集样品。 4. **次使用前应按照试剂瓶标签的说明在Buffer GW1和Buffer GW2中加入无水乙醇。 5. 使用前请检查Buffer GTL和Buffer GL是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀出现,请将Buffer GL和Buffer GTL于56℃水浴重新溶解。 6. 如果下游实验对RNA污染比较敏感,可以在加入Buffer GL前加入4 μl DNase-Free的RNase A(100 mg/ml),RNase A本试剂盒并未提供。 如果提取样品为革兰氏阳性菌,需客户自行配制Enzymatic Lysis Buffer处理菌体,其中需使用浓度为20 mg/ml的Lysozyme(溶菌酶),Lysozyme本试剂盒并未提供。 操作步骤 ⅰ革兰氏阴性菌基因组DNA的提取 1. 取细菌培养物1-5 ml(106-108个细胞,最多不超过2×109个细胞)置于离心管(自备) 中,12,000 rpm(~13,400×g)离心1分钟,尽量吸净上清。 2. 向沉淀中加入180 μl Buffer GTL,振荡使菌体重悬。 3. 加入20 μl Proteinase K,涡旋混匀,56℃孵育,直至溶液变清亮,孵育过程中每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样本分散。 注意:如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4 μl浓度为100 mg/ml 的RNase A溶液,震荡混匀,室温放置5-10分钟。 4. 加入200 μl Buffer GL,涡旋震荡充分混匀。加200 μl无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。 短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。 注意:1)如果多个样品一起操作,Buffer GL和无水乙醇可以等比例混匀后一起加入,震荡混匀。2)加入Buffer GL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。 5. 将步骤4所得溶液(包括形成的沉淀)全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心1分钟,弃废液,将吸附柱放回收集管中。 6. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。 7. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。 注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤7。 8.12 ,000 rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应(酶切、PCR等)。 9.将吸附柱置于一个新的离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200 μl Buffer GE,室温放置2-5分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。注意:1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0时洗脱效率不高。 2) 离心之前室温孵育5分钟可以增加产量。 3) 用另外的50-200 μl Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。 4) 如果要提高DNA的终浓度,可以将步骤9所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤9;若洗脱体积小于200 μl,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1 μg,推荐用50 μl Buffer GE或灭菌水洗脱。 5) 保存在水中的DNA会受到酸性水解作用影响,如需长期保存,推荐用Buffer GE洗脱并于-20℃保存。 ⅰⅰ革兰氏阳性菌基因组DNA的提取 1. 取细菌培养物1-5 ml(106-108个细胞,最多不超过2×109个细胞)置于离心管(自备) 中,12,000 rpm(~13,400×g)离心1分钟,尽量吸净上清。 2. 加入180 μl Enzymatic Lysis Buffer(自备)使菌体重悬。 Enzymatic Lysis Buffer配制方法见说明书前部分自备试剂。 3.37℃孵育30分钟。 4.加入20 μl Proteinase K涡旋震荡,充分混匀。加入200 μl Buffer GL,涡旋震荡混匀。 注意:不要把Proteinase K直接加到Buffer GL中。 5.56℃孵育30分钟。 注意:1)如果需要,95°C孵育15分钟可以使病原体失活,但是95°C孵育会造成一些DNA的降解。 2)如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4 μl浓度为100 mg/ml的RNase A溶液,震荡混匀,室温放置5-10分钟。 6. 加入200 μl无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。 注意:加入无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。 7. 将步骤6所得溶液(包括形成的沉淀)全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM),若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 8. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 9. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤9。 10.12,000 rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟彻底晾干。 注意:这一步目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应(酶切、PCR等)。 11.将吸附柱置于一个新离心管(自备)中,向吸附柱中间部位悬空加入50-200 μl Buffer GE,室温放置2-5分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。 注意:1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0时洗脱效率不高。 2) 离心之前室温孵育5分钟可以增加产量。 3) 用另外的50-200 μl Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。 4) 如果要提高DNA的终浓度,可以将步骤11所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤11; 若洗脱体积小于200 μl,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1 μg, 推荐用50 μl Buffer GE或灭菌水洗脱。 5) 保存在水中的DNA会受到酸性水解作用影响,如需长期保存,推荐用Buffer GE洗脱并于-20℃保存。 |
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