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  • 通用型柱式基因组提取试剂盒
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  • 通用型柱式基因组提取试剂盒

    实验室耗材
    阿拉丁
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商品参数
  • 所属类别:实验室耗材
  • 产品品牌:阿拉丁
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商品描述


品牌货号


英文名称

阿拉丁U665923


Universal Genomic DNA Kit

储存温度室温
运输条件常规运输
产品介绍

产品内容:

U665923Component50 T200 TStorage
U665923ABuffer GTL15 mL60 mLRT
U665923BBuffer GL15 mL50 mLRT
U665923CBuffer GW1 (concentrate)13 mL52 mLRT
U665923DBuffer GW2 (concentrate)15 mL70 mLRT
U665923EBuffer GE15 mL60 mLRT
U665923FProteinase K1.25 mL4×1.25 mLRT
U665923GSpin Columns DM with Collection Tubes50 EA200  EART

产品简介:

本试剂盒适合于从新鲜或冷冻的动物组织、细胞、血液、细菌等多种样品中提取 高纯度总DNA。本品可纯化获得分子量最大为50 kb的DNA片段,纯化过程不需使用苯 酚或氯仿等有毒溶剂,无需乙醇沉淀。本试剂盒采用优化的缓冲体系使裂解液中的 DNA高效特异的结合到硅基质离心吸附柱上, PCR和其他酶促反应的抑制剂可通过两 步洗涤步骤被有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可得到高纯度DNA。纯化 得到的DNA可以直接用于酶切、 PCR、Real-Time  PCR、文库构建、 Southern  Blot、 分子标记等下游实验。

自备试剂:无水乙醇

Enzymatic Lysis Buffer(提取革兰氏阳性菌基因组DNA时须准备)。

自备试剂: Enzymatic Lysis Buffe配方: 20 mM Tris ,pH8.0;2 mM Na2-EDTA;1.2% Triton自备试剂: X-100;终浓度为20 mg/mL的Lysozyme(溶菌酶)。

实验前准备及重要注意事项:

1.   样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。

2.   如果提取次生代谢产物大量积累或细胞壁厚的细菌培养物的基因组,建议在对数 生长期早期收集样品。

3.   **次使用前应按试剂瓶标签的说明在Buffer GW1和Buffer GW2中加入无水乙醇。

4.    使用前请检查Buffer GTL和Buffer GL是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀, 请将Buffer GL和Buffer GTL于56℃水浴重新溶解。

5.   如果下游实验对RNA污染比较敏感,可以在加入Buffer GL前加入4 μL DNase-Free 的RNase A(100 mg/mL), RNase A 本试剂盒并未提供。

操作步骤:

i     血液及细胞样本基因组提取

1.   材料处理

1a.    如果提取材料为哺乳动物抗凝血液(无核红细胞),可直接向50-200μL新鲜或冷 冻的抗凝血液样品中加入Buffer GTL补足至200μL;

1b.    如果提取材料为禽类、鸟类、两栖类或更低级生物的抗凝血液,其红细胞为有核 细胞,取5-10 μL新鲜或冷冻的抗凝血液样品,加入Buffer GTL补足至200 μL;

1c.   贴壁培养的细胞应先处理为细胞悬液(最大提取量为5×10⁶个细胞), 2,000rpm (400×g)离心5分钟,弃尽上清,加200 μL GTL,振荡至样品彻底悬浮;

注意:如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4  μL浓度为100  mg/mL的RNase  A溶液,涡旋15秒,室温放置2分钟。

2.    加入20 μL Proteinase K。

3.    加入200 μL Buffer GL,涡旋震荡充分混匀, 56℃水浴10分钟。

4.   短暂离心以去除管盖内壁的水珠。加入200μL无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。短暂离心。

注意:1)加入Buffer GL和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。

2)加入Buffer GL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。一些组织在加入Buffer GL 和无水乙醇后可能形成溶胶状产物,此时推荐进行剧烈震荡或涡旋处理。

5.   上一个步骤中所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin  Columns  DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。 12,000 rpm(~13,400 ×g) 离心1分 钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

6.    向吸附柱中加入500  μL Buffer GW1 (使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

7.    向吸附柱中加入500  μL Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤7。

8. 12,000  rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。

注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。

9.   将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μL Buffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟,12,000  rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。

注意:

1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很 大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值 低于7.0时洗脱效率不高。

2) Buffer GE在65-70℃水浴预热,离心之前室温孵育5分钟可以增加产量;用另外的50-200μL Buffer GE或 灭菌水再次洗脱可以增加产量。

3)如果要提高DNA的终浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2-5分钟,12,000 rpm离心1分钟;若洗脱体积小于200 μL,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA 的量小于1 μg,推荐用50 μL Buffer GE或灭菌水洗脱。

4)因为保存在水中的DNA会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用Buffer  GE洗脱并于-20℃保存。

ii    动物组织基因组提取

1. 材料处理

如果提取材料为动物组织,取25 mg(脾组织用量应少于10 mg);如果材料为鼠 尾,取一段长度为0.4-0.6 cm的大鼠鼠尾或两段长度为0.4-0.6 cm的小鼠鼠尾。

1a.样本进行液氮研磨或切成小块后置于1.5 mL离心管中,加入180 μL Buffer GTL, 将不同样品做好标记。

1b. 若使用匀浆器处理样本,匀浆前向样本中加入不超过80μL Buffer GTL,匀浆后 加入100 μL Buffer GTL。

注意:

1)确保各组织的量不要超出推荐范围。

2)组织样本在加入Buffer GTL之前用液氮研磨或加入Buffer GTL用匀浆器匀浆处理,可以增加裂解效率。

2.加入20 μL Proteinase K,涡旋震荡使样品彻底混匀。 56℃水浴,直至组织完全裂 解,孵育过程中可每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样品分散。

注意:

1)不同组织消化时间不同,通常1-3小时即可完成,鼠尾需要消化6-8小时,必要时过夜消 化,不会影响后续操作。

2)如果孵育和涡旋震荡后仍然有胶状物质,延长56℃孵育时间或再加入20 μL Proteinase K消化。

3)如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μL的浓度为100 mg/mL的RNase A溶液,涡旋15秒,室温放置5-10分钟。

3.    加入200  μL  Buffer  GL,涡旋震荡充分混匀, 70℃水浴10分钟。短暂离心后加入200 μL无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。

注意:

1)加入Buffer GL和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。

2) 加入Buffer GL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。  一些组织(如脾,肺)在 加入Buffer GL和无水乙醇后可能形成溶胶状产物,此时推荐进行剧烈震荡或涡旋处理。

4.   短暂离心,将步骤3所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin     Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。 12,000  rpm(~13,400×g   )离 心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

5.    向吸附柱中加入500  μL Buffer GW1  (使用前检查是否已加入无水乙醇), 12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

6.向吸附柱中加入500  μL Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇), 12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤6。

7. 12,000  rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。

注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。

8. 将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μL Buffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集DNA溶液, -20℃ 保存DNA。

注意:

1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很 大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值 低于7.0时洗脱效率不高。

2)Buffer   GE在65-70℃水浴预热,离心之前室温孵育5分钟可以增加产量;用另外的50-200   μL Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。

3)如果要提高DNA的终浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2-5分钟,12,000 rpm离心1分钟;若洗脱体积小于200μL,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果 DNA的量小于1 μg,推荐用50 μL Buffer GE或灭菌水洗脱。

4)因为保存在水中的DNA会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用Buffer  GE洗脱并于 -20℃保存。

iii   血液及细胞样本基因组提取

1.   细菌样本预处理

1a.    革兰氏阴性菌

(1)取细菌培养物1-5mL(10⁶-10⁸个细胞,最多不超过2×10⁹个细胞)置于离心 管(自备)中, 12,000 rpm(~13,400 ×g)离心1分钟,尽量吸净上清。

(2)向沉淀中加入180 μL Buffer GTL,振荡使菌体重悬。

(3)加入20 μL Proteinase K,涡旋混匀, 56℃孵育,直至菌体完全裂解,孵育 过程中每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样本分散。

注意:如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4 μL浓度为100  mg/mL的RNase  A溶液,震荡混匀,室温放置5-10分钟。

(4)加入200 μL Buffer GL,涡旋震荡混匀。

1b.    革兰氏阳性菌

(1)取细菌培养物1-5 mL(10⁶-10⁸个细胞,最多不超过2×10⁹个细胞)置于离心 管(自备)中, 12,000 rpm离心1分钟,尽量吸净上清。

(2)加入180 μL Enzymatic Lysis Buffer(自备)使菌体重悬。 

(3)37℃孵育30分钟。

(4)加入20 μL Proteinase K涡旋震荡,充分混匀。加入200 μL Buffer GL,涡旋震荡混匀。 56℃孵育30分钟。

注意:  

1)如果需要,95°C孵育15分钟可以使病原体失活,但是95°C孵育会造成一些DNA的降解。  

2)如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μL浓度为100  mg/mL的RNase  A溶液,震荡混匀,室温放置5-10分钟。

2.  加入200 μL无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。

注意:加入无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。

3.  将步骤2所得溶液(包括形成的沉淀)全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。 12,000 rpm离心1分钟, 倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

4. 向吸附柱中加入500  μL Buffer GW1  (使用前检查是否已加入无水乙醇), 12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

5.  向吸附柱中加入500  μL Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇), 12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤5。

6. 12,000 rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。

注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。

7.   将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μL Buffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟, 12,000  rpm离心1分钟,收集DNA溶液, -20℃保存DNA。

注意:

1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很 大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值 低于7.0时洗脱效率不高。

2) Buffer  GE在65-70℃水浴预热,离心之前室温孵育5分钟可以增加产量;用另外的50-200μL Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。

3)如果要提高DNA的终浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2-5分钟,12,000 rpm离心1分钟;若洗脱体积小于200 μL,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA 的量小于1 μg,推荐用50 μL Buffer GE或灭菌水洗脱。

4)因为保存在水中的DNA会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用Buffer  GE洗脱并于 -20℃保存。


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